Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd2Q0VET5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd2Q0VET5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd2Q0VET5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd2Q0VET5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd2Q0VET5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms