Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cntnap5bQ0V8T8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntnap5bQ0V8T8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms