Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms