Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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