Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms