Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms