Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms