Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms