Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms