Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox9Q04887 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms