Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms