Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms