Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms