Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms