Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms