Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms