Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms