Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IhhP97812 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IhhP97812 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms