Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tarbp2P97473 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms