Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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