Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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