Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx3P81067 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms