Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms