Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms