Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chl1P70232 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms