Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4bP68372 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms