Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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