Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Rps28P62858 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Rps28P62858 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Rps28P62858 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Rps28P62858 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Rps28P62858 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps28P62858 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms