Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpl23P62830 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl23P62830 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms