Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Smg6P61406 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms