Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms