Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms