Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpdl3bP58242 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms