Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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