Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrlP54846 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrlP54846 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrlP54846 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrlP54846 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms