Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms