Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms