Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms