Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hcls1P49710 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hcls1P49710 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hcls1P49710 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hcls1P49710 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcls1P49710 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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