Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a2P43006 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms