Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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