Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms