Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2aP35436 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2aP35436 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms