Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab23P35288 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab23P35288 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab23P35288 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab23P35288 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab23P35288 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab23P35288 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab23P35288 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab23P35288 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab23P35288 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab23P35288 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab23P35288 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms