Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Saa4P31532 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms