Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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