Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxraP28700 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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