Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Marcksl1P28667 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Marcksl1P28667 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms