Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DcnP28654 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DcnP28654 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DcnP28654 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DcnP28654 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DcnP28654 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DcnP28654 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DcnP28654 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DcnP28654 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DcnP28654 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DcnP28654 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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DcnP28654 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DcnP28654 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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