Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms